Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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