Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms