Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ccdc18Q640L5 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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