Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 A930005G22Rik-201ENSMUST00000201293 1904 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm17359-201ENSMUST00000164216 778 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm25301-201ENSMUST00000175285 113 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC121821.1-201ENSMUST00000199921 111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Prb3-ps-201ENSMUST00000204675 1111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Gm10644-201ENSMUST00000098595 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ywhae-201ENSMUST00000067664 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Kctd19-201ENSMUST00000063071 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Parvb-201ENSMUST00000023072 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Zfp62-203ENSMUST00000109198 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Hotair-201ENSMUST00000151949 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 A230009B12Rik-201ENSMUST00000159422 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm27927-201ENSMUST00000183791 126 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm27813-201ENSMUST00000184343 354 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm2404-201ENSMUST00000196197 844 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms