Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms