Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms