Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp4P35123 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms