Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms