Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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