Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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