Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms