Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Luzp1-207ENSMUST00000170102 7526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms