Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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H2-M1F7CXU4 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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