Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ephb1Q8CBF3 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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