Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms