Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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