Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms