Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms