Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Hoxa13Q62424 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Hoxa13Q62424 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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