Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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