Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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