Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpl28P41105 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms