Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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