Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zscan26-202ENSMUST00000110485 4366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Kctd21-201ENSMUST00000054107 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms