Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
P10404 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms