Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms