Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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