Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ercc8Q8CFD5 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ercc8Q8CFD5 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ercc8Q8CFD5 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ercc8Q8CFD5 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ercc8Q8CFD5 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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