Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Snx8Q8CFD4 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Snx8Q8CFD4 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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