Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac7Q8C2B3 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac7Q8C2B3 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms