Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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