Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BB287469Q3UT53 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms