Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Irx1P81068 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms