Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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