Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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