Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 C79130-201ENSMUST00000199610 4296 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm38404-201ENSMUST00000202005 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 L3mbtl3-202ENSMUST00000105519 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Eif4enif1-201ENSMUST00000020734 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Acad11-207ENSMUST00000189998 2030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm13673-201ENSMUST00000122056 531 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms