Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm13198-201ENSMUST00000119322 826 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Fam229b-204ENSMUST00000134279 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Fam229b-207ENSMUST00000137132 663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm13546-202ENSMUST00000138444 989 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm22422-201ENSMUST00000083060 135 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 1110008L16Rik-202ENSMUST00000183475 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Reg3a-201ENSMUST00000101272 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm7863-201ENSMUST00000184700 805 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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