Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms