Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms