Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Col5a3Q9JLI2 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Col5a3Q9JLI2 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Col5a3Q9JLI2 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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