Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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