Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Atg3Q9CPX6 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atg3Q9CPX6 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms