Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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