Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx8Q8CFD4 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms