Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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