Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CltcQ68FD5 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms