Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf215Q5SPX3 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms