Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.8 ms