Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dbx1P52950 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms