Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Defa6P50704 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms